Installation de NONMEM 7.1.0 sur un PC


Vous disposez :
1. d'un compilateur fortran:
- type Compaq/Digital Visual Fortran v6.6b à v6.6d
- ou GNU (logiciel gratuit, version g95 pour nm7)
2. d'un CD d'installation de nonmem 7
3. d'un PC avec Windows XP (pour les Mac, voir sur le site du constructeur)

NB: il est préférable d'utiliser XP plutôt que Vista.


1. Installez le compilateur

Permettez lui de modifier l'autoexec.bat
NB: nonmem 7 nécessite une version actualisée du compilateur.

2. Insérez le CD de nonmem 7

3. Lancez une fenêtre DOS

Placez le prompt dans la racine (si ce n'est pas le cas), le plus souvent d:\
Par défaut, l'installation se fait du lecteur CD (exemple avec la lettre D) vers le disque C et crée le répertoire c:\nm7.
La ligne de commande dépend de votre compilateur
Avec compaq visual fortran:
c:\setup7 d c:\nm7 df y link big norec i
Avec GNU g95:
c:\setup7 d c:\nm7 g95 y ar big norec i
Avec Intel Fortran 7 compiler:
c:\setup7 d c:\nm7 ifl y link big norec i
Avec Fortran 8-10:
c:\setup7 d c:\nm7 ifort y ar big norec i

Répondez aux différentes questions (yes sauf raisons personnelles particulières).

4. Actualisez la licence de nonmem

La licence est contrôlée par le fichier nonmem.lic
Ce fichier se trouve dans le répertoire
c:\nm7\license

Il faudra envoyer un email à IDSSOFTWARE@iconplc.com
pour demander un nouveau fichier nonmem.lic
qui contiendra une date d'expiration correspondante à la fin du renouvellement de licence.

[Icon ne saurait être trop prudent]

Le nouveau fichier nonmem.lic doit être copié dans le répertoire racine (ex.: c:\nm7), et dans le répertoire nm7\license.

5. Installez wings pour nonmem

Récupérez la dernière version sur le site de wings

Site de WING

6. Installez les scripts R pour nonmem

Il faut créer un répertoire
c:\nm7\run\_rfn
et y copier les scripts récupérés sur le site internet de Rfn

Site de Rfn


Pour des info tapez setup7 help

A la fin de l'installation un test est conseillé avec une base de données sur la théophylline.

Vous êtes prêt pour le grand bon en avant!


Avec les versions antérieures de nonmem,
des problèmes étaient souvent rencontrés à l'installation mais les bugs ont été corrigés.
Juste au cas où, pour les nostalgiques, j'ai laissé les messages qui étaient rencontrés...

Pour éviter les messages suivants:

Compilation failed

Vérifiez que les chemins (PATH) soient bien décrit dans l'autoexec.bat après l'installation du compilateur, éventuellement réinstallez le!
Out of environment space

Configuration classique: PC, windows 95 ou 98

Supposons que votre compilateur Fortran (présent dans le path) soit installé, reste NONMEM.

Plusieurs possibilités :

1ere possibilité

Ajouter dans le fichier system.ini la ligne suivante dans le bloc [NonWindowsApp]

CommandEnvSize=2048

NB: au lieur de 2048, vous pouvez être amené à entrer 1024 si dans le fichier config.sys à la ligne SHELL, c'est cette valeur qui est indiquée.

 

2ème possibilité

Ajouter la ligne suivante dans le fichier config.sys

shell=c:\windows\command.com c:\windows /p/e:1024

NB: une valeur de 2048 peut être nécessaire

rebootez

 

3ème possibilité

Faites un clic droit sur votre raccourci de fenêtre DOS et sélectionnez propriété puis mémoire. Dans la partie mémoire conventionnelle, la liste déroulante sur la mémoire initiale doit être mise sur 1024 (ou 2048).

Dernière possibilité

Reprendre posément le NONMEM Users guide III Chapitre VII Section 2.4.3.1